滴虫性阴道炎常伴有泌尿生殖系统及肠道内的滴虫感染，单纯局部用药，不易彻底消灭滴虫，应全身用药。
甲硝唑口服吸收好，疗效高，毒性小，丈夫或性伴侣需同时治疗（亦可应用替硝唑口服）。对于口服用药胃肠道反应严重或者不适合全身用药的患者，可选择阴道局部用药，如甲硝唑栓、甲硝唑阴道泡腾片、替硝唑栓等制剂。主要可单独局部给药也可全身及局部联合用药，以联合用药效果为佳。
用药期间需要注意：
1.不应饮用含酒精的饮料，因使用甲硝唑或者替硝唑后可引起体内乙醛蓄积，干扰酒精的氧化过程，患者可出现腹部痉挛、恶心、呕吐、头痛、面部潮红等。
2.妊娠早期服用甲硝唑有引起胎儿畸形的可能，故在妊娠20周前不可服药，应以局部治疗为主。
3.替硝唑虽无致畸作用，但可通过胎盘，也可经乳汁排出，因此妊娠
个月内应禁用。3个月以上的孕妇只有具明确指征时才选用，哺乳期妇女应避免使用
若必须用药
应暂停哺乳并在停药3日后方可授乳。12岁以下儿童禁用。
4.月经期间避免阴道用药及坐浴。在治疗期间禁止性交，或采用避孕套，以防止交叉感染。