儿外科是以新生儿外科、小儿普外科及小儿泌尿外科为主的综合性儿童外科，同时开展部分运动系统疾病诊疗，胎儿医学咨询业务等，也是绍兴市内最早开展小儿外科定点诊治的科室之一。科室对新生儿外科疾病、小儿急腹症、腹部肿物、体表肿物、腹股沟斜疝等疾病有较高的诊疗水平，其中，对于小儿腹股沟斜疝及鞘膜积液等腹腔镜微创治疗积累了丰富的经验。目前儿外科已由浙江大学医学院附属儿童医院全面托管，由省儿保的专家担任儿外科的主任兼主诊开展工作，手术水平与浙大儿院同质化管理，常规开展微创手术。儿外科主要诊治：小儿普通外科绝大部分手术和泌尿外科常规手术。其中普外科包括：腹股沟斜疝、脐疝、先天性鳃裂囊肿（瘘）、甲状舌骨囊肿、各种浅表良性肿物、新生儿十二指肠梗阻、先天性肠旋转不良、坏死性小肠结肠炎、先天性消化道畸形及各类外科急腹症（阑尾炎，肠套叠，嵌顿疝，肠梗阻）等。泌尿外科包括：鞘膜积液、包茎、隐匿阴茎、蹼状阴茎，隐睾等。